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En el presente artículo se analiza la dinámica de conflictos y cooperación que se observa en las cuencas hidrográficas transfronterizas a través de ejemplos tomados de la región mesoamericana (sur de México y América Central). La gestión compartida de estas cuencas es una cuestión importante para las fronteras afectadas. Se pretende cuestionar la dimensión política y social de la gestión de las cuencas transfronterizas tanto por las iniciativas de cooperación estudiadas como por los conflictos que puedan enfrentar a los interesados.