Association of IVS6A GATT polymorphism of CFTR gene with cystic fibrosis: first study in CF and normal Tunisian population (notice n° 274483)
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| control field | 20250117193007.0 |
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| Language code of text/sound track or separate title | fre |
| 042 ## - AUTHENTICATION CODE | |
| Authentication code | dc |
| 100 10 - MAIN ENTRY--PERSONAL NAME | |
| Personal name | Sahli, Chaima |
| Relator term | author |
| 245 00 - TITLE STATEMENT | |
| Title | Association of IVS6A GATT polymorphism of CFTR gene with cystic fibrosis: first study in CF and normal Tunisian population |
| 260 ## - PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC. | |
| Date of publication, distribution, etc. | 2020.<br/> |
| 500 ## - GENERAL NOTE | |
| General note | 47 |
| 520 ## - SUMMARY, ETC. | |
| Summary, etc. | Depuis la description du gène CFTR, plus de 2 000 mutations ont été rapportées à travers le monde documentant l’extrême variabilité génotypique et phénotypique de la pathologie. L’étude des corrélations phénotype-génotype s’avère essentielle dans cette maladie multifactorielle afin de mieux comprendre son expression clinique.Dans ce travail, nous nous sommes intéressés à étudier la répartition génotypique et allélique du polymorphisme IVS6aGATT dans une population tunisienne ainsi que d’établir son implication chez les patients mucoviscidosiques en association avec la mutation la plus commune F508del. Patients et méthodes : Notre étude a porté sur 80 enfants mucoviscidosiques et 90 sujets sains. L’étude du variant IVS6aGATT a été réalisée par l’analyse des fragments sur séquenceur automatique (ABI Prism 310). L’étude statistique a été menée par le logiciel SPSS (version 20.0). Résultats et discussion : L’analyse de la distribution génotypique du marqueur intragénique IVS6aGATT a montré une différence significative entre le groupe de contrôle et le groupe des patients, ce qui suggère l’implication de ce marqueur dans la mucoviscidose. Par ailleurs, nous avons noté que la répétition 6 GATT à l’état homozygote est plus fréquente chez les patients CF que chez le groupe des témoins avec p < 0,05. Cependant, la forme heptamètre (7GATT/7GATT) est plus commune chez les témoins par rapport aux patients CF (p = 0,002). En ce qui concerne l’intérêt de ce polymorphisme sur l’expression clinique de la mucoviscidose, nous n’avons noté aucune association significative entre le génotype 6/6 avec les différentes atteintes cliniques chez les patients mucoviscidosiques en dehors de la mutation CFTR. En revanche, une association significative a été montrée entre l’atteinte respiratoire et l’atteinte mixte (respiratoire et digestive) et le génotype 6/6 chez les patients porteurs de la mutation F508del à l’état homozygote (p < 0,05). De plus, une association significative a été également notée avec l’atteinte digestive pour les patients non F508del/non F508del (p = 0,014). Conclusion :Etant donné l’hétérogénéité phénotypique et génotypique de la mucoviscidose, plusieurs études ont cherché à mettre en évidence le rôle des marqueurs génétiques liés au gène CFTR dans l’expression et l’évolution de la maladie. Notre travail, portant sur l’intérêt du polymorphisme IVS6aGATT du gène CFTR, constitue l’un des premiers travaux effectués dans la population tunisienne et confirme l’utilité de ce marqueur dans l’expression clinique de la mucoviscidose. |
| 520 ## - SUMMARY, ETC. | |
| Summary, etc. | Background: Cystic fibrosis (CF) is the most common autosomal recessive disease in Caucasians, caused by mutation in cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR). The analysis of some extra and intragenic markers within or closely linked to CFTR gene is useful as a molecular method in clinical linkage analysis. Indeed, knowing that the molecular basis of CF is highly heterogeneous in our population is explained in the present study. In this work, we are interested for the first time to study the polymorphic marker IVS6a GATT in a CF Tunisian population. Methods: Our study involved 80 CF Tunisian patients with a positive sweat test. A cohort of 90 healthy controls was also enrolled. The analysis of the variant IVS6a GATT was conducted by analysis of the fragments on automatic sequencer (ABI Prism 310). A statistical analysis was performed on Statistical Package for the Social Sciences (SPSS) version 20 software. Results: The analysis of genotypic distribution of IVS6aGATT showed a significant difference between the control and CF groups suggesting the involvement of this marker in cystic fibrosis. Furthermore, we noted that the 6 GATT repetition in the homozygous state is more common in CF patients than in the control group (p < 0.05). This while the 7GATT/7GATT genotype is more common among controls compared to CF patients (p = 0.002). Regarding the interest of this polymorphism on the clinical expression of cystic fibrosis, we have noted no significant association between 6/6 genotype with different clinical conditions in CF patients outside the CFTR mutation. While a significant association was found between respiratory involvement and mixed (respiratory and digestive) and the 6/6 genotype in patients with the mutation F508del homozygous (p <0.05). In addition, a significant association was also noted with gastrointestinal involvement for non F508del patients/F508del not (p = 0.014). Given that, phenotypic and genotypic heterogeneity of cystic fibrosis, several studies have sought to highlight the role of genetic markers linked to the CFTR gene in the expression and evolution of the disease. Conclusion: Our study on the implication of polymorphic marker IVS6a GATT is one of the first works carried out in the Tunisian population and confirms the usefulness of this marker in the clinical expression of cystic fibrosis. |
| 690 ## - LOCAL SUBJECT ADDED ENTRY--TOPICAL TERM (OCLC, RLIN) | |
| Topical term or geographic name as entry element | gène CFTR |
| 690 ## - LOCAL SUBJECT ADDED ENTRY--TOPICAL TERM (OCLC, RLIN) | |
| Topical term or geographic name as entry element | variabilité phénotypique |
| 690 ## - LOCAL SUBJECT ADDED ENTRY--TOPICAL TERM (OCLC, RLIN) | |
| Topical term or geographic name as entry element | mutation F508del |
| 690 ## - LOCAL SUBJECT ADDED ENTRY--TOPICAL TERM (OCLC, RLIN) | |
| Topical term or geographic name as entry element | population tunisienne |
| 690 ## - LOCAL SUBJECT ADDED ENTRY--TOPICAL TERM (OCLC, RLIN) | |
| Topical term or geographic name as entry element | marqueur IVS6A GATT |
| 690 ## - LOCAL SUBJECT ADDED ENTRY--TOPICAL TERM (OCLC, RLIN) | |
| Topical term or geographic name as entry element | phenotypic variability |
| 690 ## - LOCAL SUBJECT ADDED ENTRY--TOPICAL TERM (OCLC, RLIN) | |
| Topical term or geographic name as entry element | CFTR gene |
| 690 ## - LOCAL SUBJECT ADDED ENTRY--TOPICAL TERM (OCLC, RLIN) | |
| Topical term or geographic name as entry element | F508del mutation |
| 690 ## - LOCAL SUBJECT ADDED ENTRY--TOPICAL TERM (OCLC, RLIN) | |
| Topical term or geographic name as entry element | IVS6A GATT marker |
| 690 ## - LOCAL SUBJECT ADDED ENTRY--TOPICAL TERM (OCLC, RLIN) | |
| Topical term or geographic name as entry element | Tunisian population |
| 700 10 - ADDED ENTRY--PERSONAL NAME | |
| Personal name | Hadj Fredj, Sondess |
| Relator term | author |
| 700 10 - ADDED ENTRY--PERSONAL NAME | |
| Personal name | Boussetta, Khedija |
| Relator term | author |
| 700 10 - ADDED ENTRY--PERSONAL NAME | |
| Personal name | Mehrezi, Ahmed |
| Relator term | author |
| 700 10 - ADDED ENTRY--PERSONAL NAME | |
| Personal name | Messaoud, Taieb |
| Relator term | author |
| 786 0# - DATA SOURCE ENTRY | |
| Note | Annales de Biologie Clinique | 78 | 3 | 2020-05-01 | p. 314-318 | 0003-3898 |
| 856 41 - ELECTRONIC LOCATION AND ACCESS | |
| Uniform Resource Identifier | <a href="https://shs.cairn.info/revue-annales-de-biologie-clinique-2020-3-page-314?lang=en&redirect-ssocas=7080">https://shs.cairn.info/revue-annales-de-biologie-clinique-2020-3-page-314?lang=en&redirect-ssocas=7080</a> |
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