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Facing the arrival of the COVID-19 pandemic in France, Santé Publique France has set up an evolutionary surveillance system based on definitions of possible, probable and confirmed cases. But only cases confirmed by SARS-CoV-2, RT-PCR (reverse transcriptase polymerase chain reaction) or serology, hospitalized cases and in-hospital deaths have been recorded on a daily basis. COVID-19 actual incidence has thus been estimated through additional indicators such as specific calls to emergency services (Samu) and SOS doctors, emergency rooms visits, or consultations in a sentinel network of general practitioners. Surveillance of non-hospital mortality has been impaired by delays and diagnostic inaccuracies of death certificates. Only in-hospital lethality could be reliably monitored. With a few essential statistical precautions and working hypotheses, models made it possible to anticipate the evolution of the epidemic based on two essential indicators: the reproduction ratio R, and the epidemic doubling time. In Ile-de-France region, the Greater Paris University Hospitals Group has used its data warehouse to complete this epidemic dashboard, including a fine modeling of patients’ care pathways. All these indicators have proved essential to plan the response to this unprecedented crisis.

Face à la crise sanitaire provoquée par la pandémie de Covid-19 en France, Santé publique France a mis en place un système de surveillance évolutif fondé sur des définitions de cas possible, probable et confirmé. Le décompte quotidien se limite cependant aux cas confirmés par reverse transcriptase polymerase chain reaction ou sérologie SARS-CoV-2 (actuellement via la plateforme SI-DEP), aux cas hospitalisés (via le Système d'information pour le suivi des victimes d'attentats) et aux décès hospitaliers par Covid-19. Ce suivi de la circulation virale est forcément non exhaustif, et l'estimation de l'incidence est complétée par d'autres indicateurs comme les appels au 15, les recours à SOS Médecins, les passages dans les services d'accueil des urgences, les consultations de médecine de ville via le réseau Sentinelle. Le suivi de la mortalité non hospitalière s'est heurté aux délais de transmission des certificats de décès et au manque de diagnostic fiable. Seule la létalité hospitalière a pu être mesurée de manière fiable. Moyennant un certain nombre de précautions statistiques et d'hypothèses de travail, les modèles ont permis d'anticiper l'évolution de l'épidémie à partir de deux indicateurs essentiels : le ratio de reproduction R et le temps de doublement épidémique. En Île-de-France, l'Assistance publique–Hôpitaux de Paris a complété ce tableau de bord grâce à son entrepôt de données de santé et a ainsi pu modéliser de manière fine le parcours de soins des patients. L'ensemble de ces indicateurs a été essentiel pour assurer une planification de la réponse à la crise.