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Intérêt de la PCR multiplex panel FilmArray Meningitis/Encephalitis dans le diagnostic des infections du système nerveux central

Par : Contributeur(s) : Type de matériel : TexteTexteLangue : français Détails de publication : 2023. Sujet(s) : Ressources en ligne : Abrégé : Central nervous system infections represent diagnostic and therapeutic emergencies due to the combination of vital and functional prognosis, the Multiplex PCR in real time allows rapid and simultaneous detection of many viral pathogens, The aim of this series is to study the epidemiology of the agents involved in these infections. This is a retrospective study spread over a 4-year period in the laboratory of microbiology-virology CHU Hassan II Fes, covering the records of 200 patients who were admitted into a meningitis or meningo-encephalitis and having benefited from lumbar punctures with cytobacteriological and biochemical study of CSF as well as a multiplex PCR Filmarray Panel Meningitis/Encephalitis, The sex ratio H/F was 1.6. The average age was 19.5. The requesting services were: pediatric emergencies (40%), adult emergencies (30 %), pediatric resuscitation services (17.4%) and adult resuscitation services (12.6%). The panel detected 47 positive cases, for an overall positivity rate of 23.5%. Bacterial agents accounted for 57.4% of all positive samples, dominated by Streptococcus pneumoniæ (25.6%), followed by Neisseria meningitidis (15%), Haemophilus influenzae (12.8%) and Streptocococ B (4.3%), viral etiologies accounted for 33.8 % of samples, dominated by Cytomegalovirus (12.5%), Herpes simplex virus 1 (13%) and varicella zoster virus (6%), only one case of Cryptococcus Neoformans (2%) was detected. The use of multiplex PCR among routine tests is suggested in order to start adequate treatment, to limit inappropriate antibiotic and antiviral prescriptions, and to reduce the length of hospitalizations. On the other hand there are always obstacles opposing the adoption of this new technique among them: the existence of false negatives, the high cost, as well as the non-detection of agents not targeted by this Panel.Abrégé : Les infections du système nerveux central représentent des urgences diagnostiques et thérapeutiques en raison de la mise en jeu du pronostic vital et fonctionnel. La PCR multiplex en temps réel permet une détection rapide et simultanée de nombreux agents pathogènes viraux, bactériens et fongiques. L’objectif de cette série est d’étudier l’épidémiologie des agents incriminés dans ces infections. Il s’agit d’une étude rétrospective sur une durée de quatre ans au laboratoire de microbiologie-virologie du CHU Hassan II de Fès, portant sur les dossiers de 200 patients qui ont été admis avec un tableau de méningite ou de méningoencéphalite et ayant bénéficié de ponctions lombaires avec étude cytobactériologique et biochimique de liquide céphalorachidien ainsi qu’une PCR multiplex panel FilmArray Meningitis/Encephalitis. Le sex-ratio H/F était de 1,6, la moyenne d’âge de 19,5. Les services demandeurs étaient respectivement : les urgences pédiatriques (40 %) et adultes (30 %), puis les services de réanimation pédiatrique (17,4 %) et adultes (12,6 %). Le panel a détecté 47 cas positifs, soit un taux de positivité global de 23,5 %. Les agents bactériens représentaient 57,4 % de l’ensemble des prélèvements positifs, dominés par Streptococcus pneumoniæ (25,6 %), suivi par Neisseria meningitidis (15 %), Hæmophilus influenzæ (12,8 %) et le streptococoque B (4,3 %). Les étiologies virales représentaient 33,8 % des prélèvements, dominées par le cytomégalovirus (12,5 %), l’Herpes simplex virus 1 (13 %) et le virus varicelle zona (6 %). Un seul cas de Cryptococcus neoformans (2 %) a été détecté. L’utilisation de la PCR multiplex parmi les tests de routine est suggérée afin de démarrer un traitement adéquat, de limiter les prescriptions inappropriées d’antibiotiques et d’antiviraux, et de réduire les durées d’hospitalisation. Des freins persistent cependant à l’adoption de cette nouvelle technique : l’existence de faux négatifs, le coût élevé et la non-détection des agents non ciblés par ce panel.
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Central nervous system infections represent diagnostic and therapeutic emergencies due to the combination of vital and functional prognosis, the Multiplex PCR in real time allows rapid and simultaneous detection of many viral pathogens, The aim of this series is to study the epidemiology of the agents involved in these infections. This is a retrospective study spread over a 4-year period in the laboratory of microbiology-virology CHU Hassan II Fes, covering the records of 200 patients who were admitted into a meningitis or meningo-encephalitis and having benefited from lumbar punctures with cytobacteriological and biochemical study of CSF as well as a multiplex PCR Filmarray Panel Meningitis/Encephalitis, The sex ratio H/F was 1.6. The average age was 19.5. The requesting services were: pediatric emergencies (40%), adult emergencies (30 %), pediatric resuscitation services (17.4%) and adult resuscitation services (12.6%). The panel detected 47 positive cases, for an overall positivity rate of 23.5%. Bacterial agents accounted for 57.4% of all positive samples, dominated by Streptococcus pneumoniæ (25.6%), followed by Neisseria meningitidis (15%), Haemophilus influenzae (12.8%) and Streptocococ B (4.3%), viral etiologies accounted for 33.8 % of samples, dominated by Cytomegalovirus (12.5%), Herpes simplex virus 1 (13%) and varicella zoster virus (6%), only one case of Cryptococcus Neoformans (2%) was detected. The use of multiplex PCR among routine tests is suggested in order to start adequate treatment, to limit inappropriate antibiotic and antiviral prescriptions, and to reduce the length of hospitalizations. On the other hand there are always obstacles opposing the adoption of this new technique among them: the existence of false negatives, the high cost, as well as the non-detection of agents not targeted by this Panel.

Les infections du système nerveux central représentent des urgences diagnostiques et thérapeutiques en raison de la mise en jeu du pronostic vital et fonctionnel. La PCR multiplex en temps réel permet une détection rapide et simultanée de nombreux agents pathogènes viraux, bactériens et fongiques. L’objectif de cette série est d’étudier l’épidémiologie des agents incriminés dans ces infections. Il s’agit d’une étude rétrospective sur une durée de quatre ans au laboratoire de microbiologie-virologie du CHU Hassan II de Fès, portant sur les dossiers de 200 patients qui ont été admis avec un tableau de méningite ou de méningoencéphalite et ayant bénéficié de ponctions lombaires avec étude cytobactériologique et biochimique de liquide céphalorachidien ainsi qu’une PCR multiplex panel FilmArray Meningitis/Encephalitis. Le sex-ratio H/F était de 1,6, la moyenne d’âge de 19,5. Les services demandeurs étaient respectivement : les urgences pédiatriques (40 %) et adultes (30 %), puis les services de réanimation pédiatrique (17,4 %) et adultes (12,6 %). Le panel a détecté 47 cas positifs, soit un taux de positivité global de 23,5 %. Les agents bactériens représentaient 57,4 % de l’ensemble des prélèvements positifs, dominés par Streptococcus pneumoniæ (25,6 %), suivi par Neisseria meningitidis (15 %), Hæmophilus influenzæ (12,8 %) et le streptococoque B (4,3 %). Les étiologies virales représentaient 33,8 % des prélèvements, dominées par le cytomégalovirus (12,5 %), l’Herpes simplex virus 1 (13 %) et le virus varicelle zona (6 %). Un seul cas de Cryptococcus neoformans (2 %) a été détecté. L’utilisation de la PCR multiplex parmi les tests de routine est suggérée afin de démarrer un traitement adéquat, de limiter les prescriptions inappropriées d’antibiotiques et d’antiviraux, et de réduire les durées d’hospitalisation. Des freins persistent cependant à l’adoption de cette nouvelle technique : l’existence de faux négatifs, le coût élevé et la non-détection des agents non ciblés par ce panel.

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