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Apport des milieux chromogènes Uriselect4® et CPS ID3® dans l’isolement et l’identification des germes responsables d’infections urinaires

Par : Contributeur(s) : Type de matériel : TexteTexteLangue : français Détails de publication : 2020. Sujet(s) : Ressources en ligne : Abrégé : RésuméL’identification rapide et précise des agents infectieux est primordiale pour guider l’antibiothérapie. Les géloses chromogènes ont été proposées pour rendre l’isolement et l’identification des bactéries plus rapides et plus aisés. Notre étude a eu pour but de comparer deux géloses chromogènes, la gélose CPS ID3® et l’UriSelect4®, par rapport à la méthode en utilisation routinière dans l’isolement et l’identification des germes impliqués dans les infections urinaires. Cette étude prospective menée au laboratoire de biologie de l’Institut de nutrition de Tunis en mai 2018, a inclus 301 échantillons urinaires. Les isolats des milieux de routine ont été identifiés à l’aide des galeries API®. Les isolats provenant de milieux chromogènes ont été identifiés sur la base de la coloration des colonies indiquée par le fabricant. Nous avons obtenu plus de cultures positives et monomorphes avec l’Uriselect4® et le milieu CPS ID3®. Les milieux chromogènes ont permis un meilleur isolement d’Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Citrobacter koseri, Morganella morganii et Streptococcus agalactiae. L’Uriselect4® était supérieur au CPS ID3® en termes de sensibilité et de spécificité de l’identification présomptive de la plupart des uropathogènes isolés. L’identification des germes a été en avance de 24h par rapport à la méthode classique dans 63 % des cas avec le milieu CPS ID3®, et dans 77,7 % des cas avec l’Uriselect4®. Les milieux chromogènes ont permis un meilleur isolement des germes impliqués dans les infections urinaires avec une identification présomptive rapide, facile et précise, en particulier avec l’Uriselect4®.Abrégé : Rapid and accurate identification of pathogens involved in urinary tract infections helps to guide antimicrobial therapy. Chromogenic agars provide presumptive identification directly from primary isolation media. They have been intended to make the bacterial isolation and identification process easier and faster. Our study aimed to compare the performance and the cost of the CPS ID3® and the Uriselect4® chromogenic agars with the conventional method for the isolation and identification of urinary tract infections bacteria. We included 301 urinary samples in a prospective study conducted in May 2018 in the clinical laboratory of the National institute of nutrition and food technology of Tunis. Isolates from routine media were identified using API® system while isolates from chromogenic media were directly identified by colony color with reference to the manufacturer's recommendations. Chromogenic media yielded more pure positive cultures and allowed better isolation of Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Citrobacter koseri, Morganella morganii and Streptococcus agalactiae. Sensitivity and specificity of the presumptive identification of most commonly isolated uropathogens were higher with the Uriselect4® medium than with the CPS ID3® medium. Chromogenic media yielded the identification of pathogenic organisms 24 hours sooner than the conventional method in approximately 63 % of cases with the CPS ID3® medium and in 77.7% of cases with the Uriselect4® medium. Chromogenic media allowed a much better isolation of bacteria commonly involved in urinary tract infections with a quick, easy and accurate presumptive identification especially with the Uriselect4® medium.
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RésuméL’identification rapide et précise des agents infectieux est primordiale pour guider l’antibiothérapie. Les géloses chromogènes ont été proposées pour rendre l’isolement et l’identification des bactéries plus rapides et plus aisés. Notre étude a eu pour but de comparer deux géloses chromogènes, la gélose CPS ID3® et l’UriSelect4®, par rapport à la méthode en utilisation routinière dans l’isolement et l’identification des germes impliqués dans les infections urinaires. Cette étude prospective menée au laboratoire de biologie de l’Institut de nutrition de Tunis en mai 2018, a inclus 301 échantillons urinaires. Les isolats des milieux de routine ont été identifiés à l’aide des galeries API®. Les isolats provenant de milieux chromogènes ont été identifiés sur la base de la coloration des colonies indiquée par le fabricant. Nous avons obtenu plus de cultures positives et monomorphes avec l’Uriselect4® et le milieu CPS ID3®. Les milieux chromogènes ont permis un meilleur isolement d’Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Citrobacter koseri, Morganella morganii et Streptococcus agalactiae. L’Uriselect4® était supérieur au CPS ID3® en termes de sensibilité et de spécificité de l’identification présomptive de la plupart des uropathogènes isolés. L’identification des germes a été en avance de 24h par rapport à la méthode classique dans 63 % des cas avec le milieu CPS ID3®, et dans 77,7 % des cas avec l’Uriselect4®. Les milieux chromogènes ont permis un meilleur isolement des germes impliqués dans les infections urinaires avec une identification présomptive rapide, facile et précise, en particulier avec l’Uriselect4®.

Rapid and accurate identification of pathogens involved in urinary tract infections helps to guide antimicrobial therapy. Chromogenic agars provide presumptive identification directly from primary isolation media. They have been intended to make the bacterial isolation and identification process easier and faster. Our study aimed to compare the performance and the cost of the CPS ID3® and the Uriselect4® chromogenic agars with the conventional method for the isolation and identification of urinary tract infections bacteria. We included 301 urinary samples in a prospective study conducted in May 2018 in the clinical laboratory of the National institute of nutrition and food technology of Tunis. Isolates from routine media were identified using API® system while isolates from chromogenic media were directly identified by colony color with reference to the manufacturer's recommendations. Chromogenic media yielded more pure positive cultures and allowed better isolation of Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Citrobacter koseri, Morganella morganii and Streptococcus agalactiae. Sensitivity and specificity of the presumptive identification of most commonly isolated uropathogens were higher with the Uriselect4® medium than with the CPS ID3® medium. Chromogenic media yielded the identification of pathogenic organisms 24 hours sooner than the conventional method in approximately 63 % of cases with the CPS ID3® medium and in 77.7% of cases with the Uriselect4® medium. Chromogenic media allowed a much better isolation of bacteria commonly involved in urinary tract infections with a quick, easy and accurate presumptive identification especially with the Uriselect4® medium.

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