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Genetic markers are differences between horses in the DNA sequence. The SNP (Single Nucleotid Polymorphism) chip can be used to genotype 60,000 DNA base point differences at a cost of less than €50 (without patents). The genomic information processing chain will be operational in France in 2025 for all horse subject to parentage testing. For single or oligo-gene traits such as coat color or certain pathologies, genotyping will make it possible to directly deduce the horse’s phenotype and manage high-risk mating. Certain complex traits are influenced by genes with a major effect : qualification and absence of gait faults for the French Trotter, race distance for the thoroughbred, height for many riding horses. In this case, knowledge of the genotype increases the probability of the trait in question being produced, but the result is not binary. Finally, for complex traits, an evaluation that includes all the genomic data can increase accuracy and give a better prediction of the performance of the progeny.

Les marqueurs génétiques sont des différences entre chevaux dans la séquence de l’ADN. L’outil puce SNP (Single Nucleotid Polymorphism) permet de génotyper 60 000 différences ponctuelles d’une base de l’ADN pour un coût inférieur à 50 € (hors brevets). La chaîne de traitement de l’information génomique sera opérationnelle en France en 2025 pour tout cheval soumis au contrôle de filiation. Pour les caractères mono- ou oligo-géniques tels que les robes ou certaines pathologies, ce génotypage permet de déduire directement le phénotype du cheval et de gérer les accouplements à risque. Certains caractères complexes sont sous l’influence de gènes à effet majeur : la qualification et l’absence de faute aux allures pour le Trotteur Français, la distance en course pour le Pur-Sang anglais, la taille pour beaucoup de chevaux de selle. Dans ce cas, la connaissance du génotype augmente les probabilités de réalisation du caractère concerné, mais le résultat n’est pas binaire. Enfin, pour les caractères complexes, une évaluation incluant toutes les données génomiques permet une augmentation de la précision et une meilleure prédiction des performances des produits.