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‪Este artículo examina el resurgimiento del tomismo y la creación de una “ciencia católica” en Francia, en el siglo XIX, desde el punto de vista del atomismo. Más que ningún otro ámbito de la ciencia, la cuestión de la estructura de la materia se presenta en ese período como el tema central del conflicto entre científicos anticlericales y defensores de la tradición católica romana. Estos últimos atacarán la teoría atómica, vinculada a la floreciente filosofía materialista, y propondrán la teoría escolástica de la sustancia y la forma como alternativa “concordista”. Al integrar este retorno a la filosofía de Tomás de Aquino en el tejido de la historia atómica, las posiciones antiatomicistas del historiador de la ciencia Pierre Duhem y del químico Jean-Baptiste Dumas pueden verse bajo una nueva luz.‪