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El objetivo de este trabajo es analizar la relación entre la calidad institucional y la innovación. Los estudios empíricos disponibles han analizado esta relación para el caso de las empresas. Con respecto a estos estudios, estimamos cinco modelos dinámicos de panel mediante el método generalizado de momentos para una muestra de cincuenta y tres países (compuesta por diecisiete países desarrollados y treinta y seis países en desarrollo y emergentes) observados durante el período 1996-2013. La atención se centra en tres variables institucionales: el control de la corrupción, la eficacia de los poderes públicos y la calidad de los instrumentos normativos, así como en dos indicadores sintéticos institucionales. Los resultados de la estimación indican que el aumento de los esfuerzos de lucha contra la corrupción favorece la innovación. Además, esta última se ve estimulada por un entorno institucional caracterizado por la intervención eficaz del Gobierno en la economía y por el establecimiento de políticas acertadas y normativas sólidas. Códigos JEL: O31, O5, O17, H1, K