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En este artículo presentamos el primer análisis en profundidad del papel de las asociaciones en la investigación participativa. Nuestros datos empíricos proceden de un estudio de 32 asociaciones subvencionadas por sus actividades de investigación e innovación. Comenzamos presentando estas asociaciones y su relación con el conocimiento científico. En segundo lugar, identificamos su papel en proyectos, redes e infraestructuras, utilizando los marcos conceptuales de la intermediación sistémica para la sostenibilidad. Nuestras observaciones muestran que las asociaciones son intermediarias de la investigación que facilitan la circulación de ideas y actores en los distintos niveles del sistema de investigación e innovación. De este modo, pueden participar en la transformación del sistema dominante y contribuir a las transiciones ecológicas y solidarias. Nuestro trabajo entronca con los estudios sobre innovación social. Códigos JEL: D83, O38