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La pneumocystose est une infection fongique profonde due à Pneumocystis jirovecii, un champignon cosmopolite, opportuniste et spécifique de l’Homme. Si elle demeure en France la première infection opportuniste classant au stade 4 de l’infection par le virus de l’immunodéficience humaine (VIH), elle est désormais diagnostiquée dans 80 % des cas chez des patients immunodéprimés non infectés par le VIH, tels que ceux transplantés d’organe solide, atteints d’hémopathies malignes ou traités pour une maladie de système. Se présentant sous la forme d’une pneumopathie alvéolo-interstitielle bilatérale, avec un aspect en verre dépoli dans les deux champs pulmonaires observé par tomodensitométrie thoracique, son diagnostic biologique repose sur l’examen microscopique d’un lavage broncho-alvéolaire (LBA) et sur la PCR en temps réel, réalisable aussi bien à partir d’un LBA, d’une expectoration, que d’une aspiration bronchique ou nasopharyngée. Le dosage sanguin du ß-(1,3)-D glucane est un complément du diagnostic direct. Le traitement et la prévention individuelle de la pneumocystose s’appuient en première ligne sur l’association sulfaméthoxazole-triméthoprime. P. jirovecii étant transmissible par voie aérienne, la prévention de la pneumocystose justifie l’isolement des patients infectés en chambre individuelle et la mise en place de précautions complémentaires de type gouttelettes ou air.