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Depuis la mise en évidence des premiers cas de COVID-19 sur le territoire français en 2020, le diagnostic biologique du SARS-CoV-2 a subi une évolution rapide afin d’accompagner la politique stratégique gouvernementale : dépister pour isoler et casser les chaînes de transmission. Pour répondre à l’augmentation de la demande de tests de dépistage, certains CHU ont été équipés de plateformes de biologie moléculaire de haut débit. Alors que la biologie médicale française a connu une situation inédite avec la pandémie COVID-19, cet article a pour objectifs de a) présenter le contexte d’implantation des plateformes de diagnostic virologique, les défis soulevés par leur création et leur fonctionnement ; b) d’étudier l’évolution des indicateurs de suivi d’activité, au travers de l’expérience de la plateforme COVID-19 du CHU de Rouen.