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Introducción: Evaluar la calidad de la prescripción de medicamentos en una región es probablemente una consideración importante. Sin embargo, sería más interesante comprender los factores que pueden influir en esta calidad. Objetivo: El objetivo de este estudio es analizar la influencia de los factores individuales en la racionalidad de la prescripción de medicamentos esenciales genéricos (MEG) en el distrito sanitario de Bogodogo, Uagadugú (Burkina Faso). Método: Se realizó un estudio transversal descriptivo y analítico en mayo de 2016 en quince centros de salud y promoción social del distrito sanitario de Bogodogo. Se adoptó una metodología mixta: se calcularon los indicadores de prescripción a partir de una muestra de 764 prescripciones médicas; se utilizaron técnicas de observación y entrevistas semiestructuradas con quince prescriptores para recolectar datos cualitativos, los cuales se analizaron por temas. Se utilizó la prueba de chi cuadrado seguida de una regresión logística para evaluar las relaciones entre las variables estudiadas en el umbral del 5 por ciento. Resultados: Se comprobó que la prescripción médica no era racional en el distrito sanitario de Bogodogo. La antigüedad, la cualificación, el uso de la Guía de Diagnóstico y Tratamiento, la percepción de los MEG y la experiencia personal con estos se asociaron con la racionalidad de la prescripción. Conclusión: Así, este estudio puso de manifiesto la influencia de ciertos factores individuales en la racionalidad de la prescripción de los MEG y puede ayudar a definir nuevas estrategias para mejorar la prestación de atención primaria en salud.